Protein sequencing lab

POINTS TO CONSIDER PRIOR TO VALIDATION FOR PEPTIDE MAPPING During the development of the peptide mapping procedure, knowledge and experience are gained that lead to selection of system suitability criteria and analytical method validation acceptance criteria. A final review of the procedure prior to validation can ensure that the procedure is ready for validation, reducing risk of failure to mee..

Redox-proteomics 연구에 있어 cysteine 의 modification 의 데이터 해석은 무엇보다 중요합니다.본 문헌은 oxidative cysteine modifications 의 다양한 접근방법을 소개하는 review 문헌이라 소개해드립니다. 관련문헌 링크 : Chasing Cysteine Oxidative Modifications: Proteomic Tools for Characterizing Cysteine Redox-Status - PMC (nih.gov) [ 분석 상담 ] 전화 : (02)866 2980 (직통) 070 8015 4093 이메일 : parkjw@emass.co.kr 홈페이지 : www.emass.co.kr (bioanalysis)

본 문헌은 animal glue 의 소재로서 collagen rich protein 특성을 이용하여 species typing 의 identification 에 응용할 수 있는 LC-MS 분석법을 소개하는 분석법 응용 문헌을 소개하고자 한다. 관련문헌링크 : A novel LC–MS method using collagen marker peptides for species identification of glue applicable to samples with multiple animal origins | Heritage Science | Full Text (springeropen.com) ​ [ 분석 상담 ] 전화 : (02)866 2980 (직통) 070 8015 4093 이메일 : parkjw@ema..

본 문헌은 native 한 진핵 cellular protein 들의 N말단이 특정 내인성 효소에 따른 N말단 modification 이 유발될수 있음을 소개하는 리뷰 문헌입니다. 본인들이 연구하는 단백질의 특성과 재조합단백질로의 발현시 특성 분석 항목에 있어 N말단 서열분석을 진행 전 참조하시면 분석방법을 선택하는데 있어 보다 효율적인 실험 계획을 세울수 있는 관점에서 유용한 자료라 생각되어 소개시켜드립니다. ​ 1st residue 에 해당하는 아미노산이 chemical modification 이 되지 않는다면 N말단 서열분석은 Edman degradation 분석법이나 peptide mapping 분석을 통한 N말단 서열 분석 두 가지 방법 모두 유용하며 chemical modification 이 된..

본 문헌은 재조합 단백질 생산에 있어 engineering 적으로 Met 을 제거하기 위해 사용되는 methionine aminopeptidase 에 대한 기능성 특성을 소개하는 문헌으로 native 한 조건에서도 Met-Xaa 에서 특성 아미노산이 위치하는 경우 이런 Met 이 deletion 이 일어날수 있음을 소개하는 자료도 함께 링크자료로 제공합니다. 재조합 단백질을 E.coli 와 같은 원핵 세포주에서 발현하시는 분들에게나 N-terminal sequencing 분석 전에 참고할만한 자료입니다. * 참고문헌 링크 : Removal of N-terminal methionine from recombinant proteins by engineered E. coli methionine aminopept..

창상피복제 내 콜라겐 확인/함량 시험에 대한 시험법 가이드라인 정보를 공유해드립니다. 기본 원리는 단백질의 아미노산 조성 분석과 유사 원리를 응용한 시험법으로 ASTM F2212-09 시험법을 채택하여 적용된 방법입니다. * 식약처 관련 가이드집 링크 : 창상피복재 성능 평가 시험방법 가이드라인(민원인 안내서) 상세보기|민원인안내서 | 식품의약품안전처 (mfds.go.kr) * ASTM F2212-09 원문자료 : ASTM F2212-09 - Standard Guide for Characterization of Type I Collagen as Starting Material for Surgical Implants and Substrates for Tissue Engineered Medical Produ..

본 논문은 mAb 의 생산에 있어 발현 공정 시 환경적인 pH 에 따라 Glutamate(E) 가 pyroglutamate(pE)로 bioconversion 이 될 수 있음을 in vitro 실험을 통해 약산의 pH 범위인 pH’ 5.5–6 에서 일어날 수 있음을 입증한 논문입니다. 본 문헌 내용의 중요성은 pyroglutmate 의 형성 여부에 따라 항체 단백질의 heavy chain 의 variable region 의 1차 구조적 변화에 따른 biological activity 에도 직접적인 영향을 줄 수 있다는 점과 단백질의 1차 구조 분석 항목에 해당하는 N-term sequencing 분석법에는 Edman degradation method 와 LC-MS 를 이용하여 peptide mapping ..

[ 분석 상담 ] 전화 : (02)866 2980 (직통) 070 8015 4093 이메일 : parkjw@emass.co.kr 홈페이지 : www.emass.co.kr (bioanalysis) ​ 본 논문자료는 재조합 단백질에서 동시 다발적으로 발생할 수 있는 특정 아미노산 잔기의 stress 에 따른 변형 중 한가지로 알려져 있는 Asp(D) 의 isomerization 과 Asn(N) 의 deamidation 에 대한 동시 발생에 대한 평가를 LC-MS (액체 질량분석기)를 이용하여 peptide mapping 분석을 통해 site ID 와 site 정량 분석에 대한 기술을 소개한 학술적 자료 입니다. ​ 연구에 많은 도움이 되시길 바랍니다. ​ 관련 문헌 링크

본 자료는 동등생물의약품 평가 가이드라인 개정서로서 단백질의 구조 물리화학적 특성을 규명하는데 있어 유효적절한 항목을 언급한 자료입니다. ​ 여기에는 단백질의 서열분석 기반이 주요 분석항목으로 언급되어 있는바 초기 허가관련 연구개발 단계에 참고를 드리고자 공유해드립니다. ​ 출처 : 식약처 ​ [ 관련 분석 상담 ] 전화 : (02)866 2980 (직통) 070 8015 4093 이메일 : parkjw@emass.co.kr 홈페이지 : www.emass.co.kr (bioanalysis)

1. 개요 단백질과 같은 생체 고분자의 특징을 가진 분자적 특징은 현재까지 intact form 을 유지한 조건에서 단백질에 대한 서열을 확인하는 방법은 부분 N말단 서열을 확인하는 edman degradation method 이외에는 대체 분석법이 없는게 현재 추세이며 따라서 단백질의 서열을 효과적으로 분석해낼 수 있는 방법은 그 단백질의 peptide 로 저분자화 시키는 전처리과정을 통해 얻어진 total peptide 시료를 질량 분석 장비나 LC(HPLC, UHPLC,nanoLC) 크로마토그래피 분석 장비를 이용하여 효율적인 분리가 되는 조건하에서 각 분석장비의 검출기(detector)로 부터 검출된 peptide 마다 fingerprinting 특이값의 해석을 통해 유전자가 암호화한 서열과의 동..