Protein sequencing lab

Native protein 발현조건에서 초기 연구를 수행하는 단계에서 단백질의 신호/면역 관련 반응에 따라 반응하는 단백질을 연구하는 학문분야를 proteomics 분석이라고 한다. 또한 재조합 단백질의 경우 단백질 순도를 검증하기 위한 단백질 전기영동을 수행했을 때 의도하지 않게 불순물 단백질(impurity protein)으로 분류되는 unknown protein 이 관찰되기도 한다. 이러한 unknown 단백질을 지정된 단일 또는 소수의 reference sequence 정보에만 국한되지 않고 그 단백질이 유래(origin)를 밝히기 위해 다양한 생물종의 sequence library 검색을 신속하게 peptide fingerprinting / partial MS/MS sequencing 분석 통해..

재조합 단백질 발현 시 의도하거나 의도치 않은 특성 아미노산 위치에서 chemical modification 이 종종 발생할수 있다. 의도한 경우에는 그 단백질 고유의 생물학적 기능을 발휘하는데 필수적인 변동도 있으나 대부분은 의도치 않게 발생하여 단백질의 생물학적 기능을 저해하는 방향으로 발현되기도 한다. 이러한 서열 다양체는 단백질의 구조 분석 항목 중 sequence variation 을 적절히 공정상 관리함으로써 단백질 품질을 유지할수 수 있는 평가 항목에 해당한다. 여기에는 대표적으로 oxidation, pyroglutamate bioconversion, acethylation 등 다양한 아미노산 변형이 있으며 이들은 보통 유전자에서 변형이 유발되어 발현된 조건이 아닌 번역 후 단백질의 성숙과정..