단백질과 같은 고차구조의 생체 고분자의 서열 확인을 위해서는 peptide mapping 분석 접근을 기초로 하여 얻어진 각각의 peptide 에 대한 MS/MS 해석을 통해 peptide 의 서열정보 해석을 진행함으로써 N-term sequence, internal sequence, C-term sequence 영역을 포함하는 logic 한 서열 결과의 입증이 가능합니다.
본 분석의 design 된 재조합 조건으로 발현된 단백질의 서열을 입증을 통해 세포주에서 발현 및 성숙과정에서 일어날 수 있는 서열 변화 유/무를 확인하고 생산된 단백질의 1차 구조적 신뢰성을 평가하는 유효한 분석법입니다.
분석 범위는 유전자가 번역(translation) 후 확인된 전체 아미노산 서열을 reference sequence 로 하여 분석 기준을 정하고 실제 단백질로 부터 얻어진 peptide 조각의 부분서열에 대한 각각의 결과가 reference sequence 와의 상동성을 입증하거나 혹시 다른 결과가 얻어진 경우 그 결과에 대한 해석 데이터를 범위에 포함합니다.
그 예상 서열과 1차 불일 치 원인은 다양하며 1) 단백질에서 유래된 서열 변화 2)chemical stress 에 의한 인위적 변화 등이 모두 설명할 수 있는 결과만을 최종 보고서에 정리해야합니다.
또한 peptide mapping 분석 시 대조군과의 비교 시험이 원칙이나 reference sample(STD protein)이 확립되지 않은 경우에는 시료 단독의 peptide mapping 분석결과를 보완하는데 있어서도 유효가 분석 방법입니다.
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